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NGS平臺

生物制品質(zhì)控檢查中常用核酸檢測方法,其中NGS方法相比于傳統(tǒng)方法和qPCR方法,利用將DNA或RNA樣本分割成小片段,并同時(shí)對這些片段進(jìn)行大規(guī)模平行定序(Parallel Sequencing),因此具有對未知新型病毒檢測的能力,無偏檢測,檢測范圍廣,具有較高的準(zhǔn)確性和敏感度, 安全性高等優(yōu)勢,可用于細(xì)胞表征、外源因子檢測、全基因序列測定。目前,NGS用于生物制品質(zhì)控檢測尚無標(biāo)準(zhǔn)化檢測流程,相關(guān)法規(guī)雖已建議使用,但缺乏細(xì)節(jié)和驗(yàn)證。


依托嚴(yán)格的質(zhì)量控制體系,湖州申科根據(jù)生物制品質(zhì)控要求,建立了滿足生物制品安全檢測需要的HZSKBio? NGS檢測平臺,提供包含核酸提取、文庫構(gòu)建、上機(jī)測序、生信分析、報(bào)告解讀的符合生物制品質(zhì)控安全要求的全流程的專業(yè)的GMP級NGS檢測服務(wù)。而我們的優(yōu)勢在于:

?  完整的生信分析:

已建立基于機(jī)器學(xué)習(xí)算法,涵蓋不同原理的檢測軟件分析組合,加上自主開發(fā)的流程與質(zhì)控,有效降低背景噪音減少干擾,而且整套流程擁有完整驗(yàn)證,保證穩(wěn)定的檢測結(jié)果。

?  專業(yè)的生物制質(zhì)量控NGS數(shù)據(jù)庫:

自主建構(gòu)檢測生物制品所需的病毒、基因組與載體數(shù)據(jù)庫,來源包含:中國藥典與國外藥典所提及的、不同工業(yè)細(xì)胞株(如293T、CHO等)常見污染的、歷史報(bào)告污染事件所涉及的,然而入庫序列都會進(jìn)行校正,防止假陽性。

?  完整的數(shù)據(jù)管理:

建立樣品數(shù)據(jù)庫時(shí),全面紀(jì)錄建庫過程及相關(guān)數(shù)據(jù),而我們創(chuàng)立了代碼管理系統(tǒng)紀(jì)錄生信分析流程演進(jìn),并且滿足FDA 21 CFR Part 11要求。




湖州申科基于專業(yè)的生物安全檢測知識和先進(jìn)的NGS技術(shù)平臺為客戶提供如下服務(wù):

?? 細(xì)胞表征

在生物制藥中細(xì)胞庫的種屬鑒定中,NGS具有表中所示的全面優(yōu)勢,HZSKBio? NGS可以一次性獲取細(xì)胞庫的:

① 物種鑒定;② 種屬來源;③ 染色體大結(jié)構(gòu)變化;④ 遺傳漂變;⑤ 外源因子污染;⑥ 種間污染;⑦ 種內(nèi)污染

 

?? 外源因子檢測

生產(chǎn)用的細(xì)胞和改造的外源因子,因生產(chǎn)過程中操作者、原材料、環(huán)境而引入外源病毒或潛伏性病毒。

HZSKBio? NGS可以針對樣品中宿主類型不同在實(shí)驗(yàn)流程中進(jìn)行去除宿主基因,提高檢測靈敏度,開發(fā)了針對生物制品的細(xì)胞庫、菌種庫、病毒庫的數(shù)據(jù)庫,可檢測樣品中存在的外源因子。

 

?? 全基因序列測定

HZSKBio? NGS可以對客戶樣本進(jìn)行NGS全基因測序,可以根據(jù)建立的參考基因組進(jìn)行有參分析,對測序結(jié)果與預(yù)期序列進(jìn)行對比分析,這對于基因型分析、突變檢測和基因組結(jié)構(gòu)變異的檢測非常有用。

另外,也提供無參分析,對于探索未知基因組進(jìn)行大規(guī)模且全面的分析,幫助深入了解客戶樣品的結(jié)構(gòu)和功能。

 

?? 定制化NGS檢測服務(wù)

基于HZSKBio? NGS技術(shù)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),滿足特定需求。


參考資料:

所有技術(shù)服務(wù)

技術(shù)服務(wù)

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